Hal ini menimbulkan spekulasi jika Soekarno lah yang menyuruh atau setidaknya Soekarno mengetahui rencana tersebut.
Mengingat para jenderal TNI yang beberbeda pendapat dengannya, maka ia akan melakukan apapun untuk tetap berkuasa. Namun hal ini diyakini hanyalah teori untuk mengkambing hitamkan Soekarno.
6. Teori keenam: konspirasi PKI antara Mao Zedong, Soekarno dan Aidit
Teori ini seceritakan dalam buku Kudeta 1 Oktober oleh ilmuwan Ceko bernama Victor Miroslav Fic.
Dalam bukunya, ia menceritkan jika peristiwa 30 September 1965 merupakan konspirasi dari Mao Zedong, Soekarno dan Aidit yang berusaha untuk mempertahankan ideologi komunis8 ditengah perbedaan pendapat pada saat itu.
7. Teori ketujuh: PKI dalang G30SPKI
Menurut Brackman pada bukunya Collapse In Indonesia, PKI melakukan rekayasa didalam angkatan bersenjata. Hal ini diperkuat dengan catatan Central Comitte PKI, motif dari peristiwa ini dikarenakan Partai Komunis Indonesia ingin menjadi partai tunggal dan menjadikan Indonesia sebagai negara komunis.
8. Teori kedelapan: Syam Kamruzaman Perancang Gerakan 30 September