Pimpinan para Wali
Sementara itu, Habib Abu Bakar Gresik merupakan pimpinan para wali di dunia pada masa itu. Sehingga Habib Bakar mendapat julukan Al Qutb atau pimpinan para wali.
Habib Abu Bakar Bin Muhammad Assegaf Gresik adalah sosok wali Qutub yang luar biasa.
Haul beliau menjadi salah satu Haul terbesar di Indonesia. Makamnya diziarahi para Habaib sedunia. Menurut Guru Sekumpul ada tiga Wali Allah yang nama dan maqomnya sama yaitu Habib Abu Bakar Bin Abdullah Alidrus Habib Abu Bakar bin Abdullah Al Attos, dan Habib Abu Bakar Bin Muhammad Assegaf Gresik.
Semasa hidupnya, Habib Abu Bakar mengisi hidupnya dengan mengajar dan membersihkan hati. Dalam majelis pengajiannya beliau menghatamkan kitab ihya' Ulumuddin sebanyak 40 kali.
Sedangkan di rumahnya sendiri beliau menghatamkan kitab Ihya' sebanyak 90 kali. Totalnya adalah 130 kali khatam.
Habib Abu Bakar dikenal salah satu ulama yang memiliki banyak karomah dan keistimewaan dari kecil hingga wafat. Sehingga banyak cerita yang sangat menakjubkan tentang beliau.
Kisah ini menceritakan ketika Habib Abu Bakar wafat.
Saat semua penduduk kota Gresik sepi mensholati jenazah Habib Abu Bakar Assegaf Gresik ada seorang bapak membeli daging kambing di Pasar Gresik.
Kemudian Bapak itu bertanya kepada penjual daging
"Pak mengapa pasar ini sepi dan engkau terlihat tergesa-gesa?"
"Habib Abu Bakar wafat, sekarang waktunya mensholati beliau. Ayo ke sana," jawab penjual daging itu.
Bapak pembeli daging langsung berangkat ke masjid Jami' untuk ikut serta mensholatkan Habib Abu Bakar Assegaf, sambil membawa bungkusan daging.
Saat akan diangkat jenazah Habib Abu Bakat terlihat sama sekali tidak terangkat dan ratusan ribu orang heran.
Putra dan Dzurriah Habib Abu Bakar ingat bahwa Habib Abu Bakar senang dibacakan Shalawat Nabi.